مرکز تحقیقات مایکوباکتریولوژی

محققان براي تشخيص بيماري سل روشي را ابداع كرده اند كه در آن با توالي يابيDNAيجدا شده از خلط  مي توان باكتري مولد بيماري سل را شناسايي و خصوصيات آن را مورد ارزيابي قرار داد . در نتيجه با استفاده از از اين روش كه Metagenomicsناميده مي شود ، بدون نياز به صرف زمان طولاني براي رشد باكتري بر روي محيط كشت ، بيماري قابل تشخيص است .

تشخيص آزمايشگاهي بيماري سل در حال حاضر نيازمند روش هاي مرسوم طولاني مدتي است كه هفته ها يا حتي ماهها به طول مي انجامد و تكيه بر اين روش هاي متداول ،  در واقع استفاده از تكنيك هايي است كه قدمت آنها به سال 1880 برمي گردد .

روش Metagenomics با استفاده از آخرين فن آوري هاي توالي يابي و بيوانفورماتيك هوشمند به ما اين اجازه را مي دهد تا به تشخيص باكتري سل با استفاده از يك ماده ( خلط) در طي يك يا دو روز بپردازيم . در اين تكنيك نيازي به رشد باكتري نيست ، از طرفي به ما بينش هاي كليدي در زمينه ي توالي ژنوم باكتري و دودمانش داده مي شود .  

طبق نظر پژوهشگران اين مطالعه ، سل به عنوان يك معضل بزرگ در آفريقا و نيز كل جهان محسوب مي شود از اين رو شناسايي روش هاي تشخيصي براي اين بيماري مهلك و كشنده بسيار هيجان انگيز است .

اين تيم تحقيقاتي ، DNA باكتري سل را در تمامي هشت نمونه ي خلط مورد مطالعه ، توالي يابي كردند و قادر به تشخيص باكتري و دودمان شناخته شده ي آن در هفت نمونه شدند . دو نمونه توالي يابي شده ، توالي Mycobacterium africanum كه ويژه غرب آفريقاست را نشان دادند .

محققان پيش از اين نيز از روش فوق براي شناسايي پاتوژن هاي باكتريايي در اجساد باستاني استفاده كرده بودند .

  سال گذشته اين تيم تحقيقاتي از روش Metagenomics براي تشخيص و رديابي باكتري coli.Eدر يك موميايي  200ساله ي مجارستاني استفاده كردند . در اوايل سال جاري ، آنها ژنوم بروسلا را كه سبب عفونتي به نام تب مالت در دامها و انسان مي شود را از يك اسكلت 700 ساله ايتاليايي بازيافت كردند .

هدف اين تيم تحقيقاتي استفاده از اين تكنيك بر روي طيف وسيعي از نمونه هاست . آنها اميدوارند كه به كمك اين روش بتوانند عفونتهاي توام را كه توسط چند باكتري به طور هم زمان رخ مي دهد را تشخيص دهند .

با اين حال پژوهشگران نيازمند بهبود و افزايش حساسيت اين تكنيك مي باشند ، اما خوشحال اند كه با استفاده از آن توانسته اند تكامل و گسترش و ظهور پاتوژن هاي ميكروبي را در گذشته و حال ارزيابي كنند .

منبع : www.sciencedaily.com